Mandag den 11. august 2014.- En international undersøgelse med spansk deltagelse identificerer en mekanisme, hvormed hundreder af mutationer introduceres i lunge- og kolorektale tumorer.
Transduktion af sekvenser i DNA er et lidt kendt fænomen og betragtes som sjældent. Dets hovedperson er 50% af genomet kaldet parasitisk DNA, dannet af elementer, som lejlighedsvis gentager sig og migrerer til andre steder i den genetiske sekvens.
"Vi har observeret, at en bestemt type sekvenstransduktion relateret til en region i genomet kaldet LINE-1 er temmelig hyppig, især i lunger og tyktarmskræftgenomer, " siger José Tubío, en forsker ved Wellcome Trust Sanger Institute of Cambridge og den første underskriver af artiklen, der er offentliggjort i tidsskriftet Science.
Sammen med ham og som en del af en stor international gruppe forskere har fire andre spanske forskere i Cambridge deltaget i arbejdet: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora og Pablo Román.
For at nå denne konklusion udviklede forskerne en algoritme, der identificerer og lokaliserer oprindelsen og de nye placeringer af de mobile LINE-1-elementer.
”At vide, hvilke transponerbare elementer i vores genom har aktivitet i tumorer, og hvor de gemmer sig, åbner dørene for design af medikamenter, der dæmper den mutagene aktivitet af disse 74 elementer i kræft, uden behov for at bruge bredspektrede medikamenter, der kan påvirke andre. regioner i genomet, "siger Román, en af medforfatterne af værket og i øjeblikket forsker ved HUCA inden for knoglemineralisme.
På den anden side "fandt vi ud af, at der var epigenetiske ændringer forbundet med migrationen af transponerbare elementer. I betragtning af at epigenetiske ændringer er tæt knyttet til miljøet peger dette arbejde på en ny måde at sammenhænge mellem genomet og hvordan vi spiser og indånder.", siger Roman.
Med ordene fra Tubio, "vil det være nødvendigt at foretage flere undersøgelser for at besvare de spørgsmål, der stilles af denne forskning om de funktionelle konsekvenser af den mekanisme, vi har observeret, men der er ingen tvivl om, at dette fund giver et nyt perspektiv af interesse for diagnose og behandling. kræftlæge. "
Kilde:
Tags:
Sundhed Køn Forskellige
Transduktion af sekvenser i DNA er et lidt kendt fænomen og betragtes som sjældent. Dets hovedperson er 50% af genomet kaldet parasitisk DNA, dannet af elementer, som lejlighedsvis gentager sig og migrerer til andre steder i den genetiske sekvens.
"Vi har observeret, at en bestemt type sekvenstransduktion relateret til en region i genomet kaldet LINE-1 er temmelig hyppig, især i lunger og tyktarmskræftgenomer, " siger José Tubío, en forsker ved Wellcome Trust Sanger Institute of Cambridge og den første underskriver af artiklen, der er offentliggjort i tidsskriftet Science.
Sammen med ham og som en del af en stor international gruppe forskere har fire andre spanske forskere i Cambridge deltaget i arbejdet: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora og Pablo Román.
Placering af de mest aktive elementer
Forskerne analyserede mobiliteten af LINE-1-elementer i 300 genomer af 12 forskellige typer kræft og observerede, at kun 74 af de 500.000 transponerbare elementer af type LINE-1, der er til stede i humant DNA, er i stand til at bevæge sig i kræftgenomer. .For at nå denne konklusion udviklede forskerne en algoritme, der identificerer og lokaliserer oprindelsen og de nye placeringer af de mobile LINE-1-elementer.
”At vide, hvilke transponerbare elementer i vores genom har aktivitet i tumorer, og hvor de gemmer sig, åbner dørene for design af medikamenter, der dæmper den mutagene aktivitet af disse 74 elementer i kræft, uden behov for at bruge bredspektrede medikamenter, der kan påvirke andre. regioner i genomet, "siger Román, en af medforfatterne af værket og i øjeblikket forsker ved HUCA inden for knoglemineralisme.
Mobilisering af komplette gener
Som forskerne observerede involverer sekvenstransduktion, der er resultatet af aktiviteten af LINE-1-elementer, undertiden mobilisering af komplette gener og deres overførsel til andre regioner af DNA'et. Derfor ændres strukturen, antallet af gener og genomekspression.På den anden side "fandt vi ud af, at der var epigenetiske ændringer forbundet med migrationen af transponerbare elementer. I betragtning af at epigenetiske ændringer er tæt knyttet til miljøet peger dette arbejde på en ny måde at sammenhænge mellem genomet og hvordan vi spiser og indånder.", siger Roman.
Med ordene fra Tubio, "vil det være nødvendigt at foretage flere undersøgelser for at besvare de spørgsmål, der stilles af denne forskning om de funktionelle konsekvenser af den mekanisme, vi har observeret, men der er ingen tvivl om, at dette fund giver et nyt perspektiv af interesse for diagnose og behandling. kræftlæge. "
Kilde:
