Onsdag den 18. september 2013.- Forskere ved University of California, San Diego, i USA, foreslår en ny tilgang kaldet netværksbaseret stratificering (NBS) til at identificere kræftsubtyper efter, hvordan mutationer påvirker de netværk eller genetiske systemer, der deles i stedet for af de enkelte patienters enestående mutationer, som offentliggjort i søndagens avancerede digitale udgave af 'Naturmetoder'.
Kræfttumorer deler næsten aldrig de samme nøjagtige genetiske mutationer, et faktum, der har forvirret videnskabelige bestræbelser på at klassificere kræftformer bedre og udvikle mere specifikke og effektive behandlinger.
"Subtyping er det mest basale skridt hen imod målet om personlig medicin, " sagde hovedforsker Trey Ideker, leder af afdelingen for genetik ved University of California School of Medicine, San Diego, og professor i afdelingerne i Medicin og bioingeniør i det samme universitetscenter.
"Baseret på patientdata placeres patienter i undertyper med tilknyttede behandlinger. F.eks. Vides det, at en kræftsubtype reagerer godt på medicin A, men ikke på lægemiddel B. Uden undertyper har hver patient den samme aspekt pr. definition, og vi ved ikke, hvordan vi skal handle anderledes, ”forklarede han.
De seneste fremskridt inden for viden og teknologi har gjort det lettere (og billigere) at sekvensere individuelle genomer, især i behandlingen af kræft, som grundlæggende er en sygdom i generne.
Men generne er "enormt heterogene, " sagde Ideker. De muterede gener, der er påvirket af andre faktorer, forårsager sygdomme som kræft, en patologi, der er genetisk unik hos hver patient, et faktum, der kan påvirke effektiviteten og resultaterne af klinisk behandling.
”Når vi ser på patientdata på genetiveau, ser alle anderledes ud, ” sagde Ideker. "Men hvis du ser på netværkene og de berørte biologiske systemer, ser de ud til at være klynger. Der er ingen muterede gener på samme sted, men mutationerne forekommer i de samme genetiske veje, " sagde denne ekspert.
Specifikt observerede forskerne somatiske mutationer, der er til stede i tumorer, men ikke i sunde væv, i data fra patienter med lunge-, livmoder- og æggestokkræft udarbejdet af Cancer Genome Atlas, et fortsat program fra National Institutes of Amerikansk helbred til at samle og katalogisere genomer fra tusinder af kræftpatienter.
Ideker sagde, at NBS-fremgangsmåden har øjeblikkelig klinisk anvendelighed. Genomsekvensbestemmelse af kræftpatienter bliver hurtigt en standarddel af diagnosen, så ifølge denne videnskabsmand kan læger bruge NBS til bedre at tilpasse en behandling med kræftundertypen og afhængigt af behandlingsresultaterne Bringe fundene tilbage til databasen for at forfine og forbedre kræftbehandlinger, så de er så personaliserede som muligt for individerne selv.
Kilde:
Tags:
Lægemidler Check-Out Regenerering
Kræfttumorer deler næsten aldrig de samme nøjagtige genetiske mutationer, et faktum, der har forvirret videnskabelige bestræbelser på at klassificere kræftformer bedre og udvikle mere specifikke og effektive behandlinger.
"Subtyping er det mest basale skridt hen imod målet om personlig medicin, " sagde hovedforsker Trey Ideker, leder af afdelingen for genetik ved University of California School of Medicine, San Diego, og professor i afdelingerne i Medicin og bioingeniør i det samme universitetscenter.
"Baseret på patientdata placeres patienter i undertyper med tilknyttede behandlinger. F.eks. Vides det, at en kræftsubtype reagerer godt på medicin A, men ikke på lægemiddel B. Uden undertyper har hver patient den samme aspekt pr. definition, og vi ved ikke, hvordan vi skal handle anderledes, ”forklarede han.
De seneste fremskridt inden for viden og teknologi har gjort det lettere (og billigere) at sekvensere individuelle genomer, især i behandlingen af kræft, som grundlæggende er en sygdom i generne.
Men generne er "enormt heterogene, " sagde Ideker. De muterede gener, der er påvirket af andre faktorer, forårsager sygdomme som kræft, en patologi, der er genetisk unik hos hver patient, et faktum, der kan påvirke effektiviteten og resultaterne af klinisk behandling.
”Når vi ser på patientdata på genetiveau, ser alle anderledes ud, ” sagde Ideker. "Men hvis du ser på netværkene og de berørte biologiske systemer, ser de ud til at være klynger. Der er ingen muterede gener på samme sted, men mutationerne forekommer i de samme genetiske veje, " sagde denne ekspert.
Specifikt observerede forskerne somatiske mutationer, der er til stede i tumorer, men ikke i sunde væv, i data fra patienter med lunge-, livmoder- og æggestokkræft udarbejdet af Cancer Genome Atlas, et fortsat program fra National Institutes of Amerikansk helbred til at samle og katalogisere genomer fra tusinder af kræftpatienter.
Ideker sagde, at NBS-fremgangsmåden har øjeblikkelig klinisk anvendelighed. Genomsekvensbestemmelse af kræftpatienter bliver hurtigt en standarddel af diagnosen, så ifølge denne videnskabsmand kan læger bruge NBS til bedre at tilpasse en behandling med kræftundertypen og afhængigt af behandlingsresultaterne Bringe fundene tilbage til databasen for at forfine og forbedre kræftbehandlinger, så de er så personaliserede som muligt for individerne selv.
Kilde:
